Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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CLDN9O95484 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN9O95484 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN9O95484 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN9O95484 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
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CLDN9O95484 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN9O95484 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN9O95484 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN9O95484 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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CLDN9O95484 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
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CLDN9O95484 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
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CLDN9O95484 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CLDN9O95484 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
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CLDN9O95484 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
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