Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
C2orf88Q9BSF0 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-5.49□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-5.49□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-5.5□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-5.52□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-5.53□□□□□ -3.29
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-5.54□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-5.55□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-5.56□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-5.57□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-5.58□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-5.59□□□□□ -3.3
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-5.6□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-5.61□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-5.62□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-5.62□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-5.63□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-5.64□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-5.65□□□□□ -3.31
C2orf88Q9BSF0 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.67□□□□□ -3.32
C2orf88Q9BSF0 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
C2orf88Q9BSF0 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-5.67□□□□□ -3.32
C2orf88Q9BSF0 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-5.68□□□□□ -3.32
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
C2orf88Q9BSF0 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
C2orf88Q9BSF0 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-5.7□□□□□ -3.32
C2orf88Q9BSF0 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-5.72□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-5.72□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-5.73□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 SOX2OT_exon4.1-201ENST00000610449 109 ntBASIC-5.74□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-5.76□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-5.76□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-5.78□□□□□ -3.33
C2orf88Q9BSF0 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-5.79□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-5.8□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-5.81□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-5.82□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-5.83□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-5.84□□□□□ -3.34
C2orf88Q9BSF0 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-5.85□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-5.86□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-5.87□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-5.88□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-5.89□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
C2orf88Q9BSF0 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-5.9□□□□□ -3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.6 ms