Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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USP49Q70CQ1 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
USP49Q70CQ1 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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USP49Q70CQ1 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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USP49Q70CQ1 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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USP49Q70CQ1 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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USP49Q70CQ1 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
USP49Q70CQ1 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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USP49Q70CQ1 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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USP49Q70CQ1 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USP49Q70CQ1 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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