Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATP2B3Q16720 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATP2B3Q16720 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
ATP2B3Q16720 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATP2B3Q16720 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ATP2B3Q16720 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ATP2B3Q16720 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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