Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SIX1Q15475 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SIX1Q15475 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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SIX1Q15475 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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SIX1Q15475 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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SIX1Q15475 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SIX1Q15475 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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SIX1Q15475 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
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SIX1Q15475 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
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SIX1Q15475 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SIX1Q15475 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SIX1Q15475 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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SIX1Q15475 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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SIX1Q15475 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
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SIX1Q15475 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SIX1Q15475 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SIX1Q15475 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SIX1Q15475 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SIX1Q15475 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
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SIX1Q15475 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SIX1Q15475 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SIX1Q15475 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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