Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
NAE1Q13564 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NAE1Q13564 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NAE1Q13564 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NAE1Q13564 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NAE1Q13564 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
NAE1Q13564 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1794.2 ms