Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
RIPK1Q13546 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RIPK1Q13546 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
RIPK1Q13546 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
RIPK1Q13546 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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