Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
GRIN2AQ12879 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
GRIN2AQ12879 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
GRIN2AQ12879 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.33□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
GRIN2AQ12879 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-4.38□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
GRIN2AQ12879 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.47□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
GRIN2AQ12879 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
GRIN2AQ12879 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.57□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
GRIN2AQ12879 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
GRIN2AQ12879 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
GRIN2AQ12879 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
GRIN2AQ12879 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
GRIN2AQ12879 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
GRIN2AQ12879 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
GRIN2AQ12879 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
GRIN2AQ12879 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.2 ms