Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRXP46100 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRXP46100 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRXP46100 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRXP46100 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRXP46100 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRXP46100 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRXP46100 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRXP46100 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRXP46100 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRXP46100 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRXP46100 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRXP46100 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRXP46100 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRXP46100 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRXP46100 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRXP46100 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATRXP46100 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ATRXP46100 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRXP46100 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRXP46100 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRXP46100 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRXP46100 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRXP46100 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ATRXP46100 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRXP46100 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRXP46100 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRXP46100 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRXP46100 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRXP46100 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRXP46100 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRXP46100 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRXP46100 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRXP46100 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRXP46100 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRXP46100 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRXP46100 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRXP46100 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRXP46100 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRXP46100 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRXP46100 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ATRXP46100 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRXP46100 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRXP46100 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRXP46100 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATRXP46100 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRXP46100 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRXP46100 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRXP46100 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATRXP46100 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATRXP46100 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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