Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TMPOP42166 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TMPOP42166 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TMPOP42166 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TMPOP42166 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TMPOP42166 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TMPOP42166 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TMPOP42166 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TMPOP42166 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TMPOP42166 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TMPOP42166 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TMPOP42166 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TMPOP42166 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TMPOP42166 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TMPOP42166 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TMPOP42166 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TMPOP42166 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TMPOP42166 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TMPOP42166 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TMPOP42166 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TMPOP42166 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TMPOP42166 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TMPOP42166 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TMPOP42166 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TMPOP42166 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TMPOP42166 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TMPOP42166 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TMPOP42166 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TMPOP42166 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TMPOP42166 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TMPOP42166 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TMPOP42166 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TMPOP42166 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TMPOP42166 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TMPOP42166 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TMPOP42166 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
TMPOP42166 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TMPOP42166 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
TMPOP42166 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TMPOP42166 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
TMPOP42166 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TMPOP42166 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TMPOP42166 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
TMPOP42166 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
TMPOP42166 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TMPOP42166 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TMPOP42166 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TMPOP42166 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TMPOP42166 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TMPOP42166 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TMPOP42166 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMPOP42166 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMPOP42166 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMPOP42166 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TMPOP42166 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TMPOP42166 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TMPOP42166 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TMPOP42166 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMPOP42166 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
TMPOP42166 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TMPOP42166 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TMPOP42166 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TMPOP42166 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
TMPOP42166 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TMPOP42166 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TMPOP42166 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
TMPOP42166 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TMPOP42166 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
TMPOP42166 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TMPOP42166 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
TMPOP42166 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TMPOP42166 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TMPOP42166 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
TMPOP42166 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
TMPOP42166 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms