Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.75□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms