Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
NISCHQ9Y2I1 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
NISCHQ9Y2I1 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
NISCHQ9Y2I1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-3.13□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms