Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SCN11AQ9UI33 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-3.96□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
SCN11AQ9UI33 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SCN11AQ9UI33 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-4.05□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SCN11AQ9UI33 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.3 ms