Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
EHD3Q9NZN3 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
EHD3Q9NZN3 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
EHD3Q9NZN3 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
EHD3Q9NZN3 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
EHD3Q9NZN3 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
EHD3Q9NZN3 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
EHD3Q9NZN3 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
EHD3Q9NZN3 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
EHD3Q9NZN3 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms