Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Q1T7F1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Q1T7F1 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Q1T7F1 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Q1T7F1 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Q1T7F1 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Q1T7F1 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Q1T7F1 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Q1T7F1 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Q1T7F1 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
Q1T7F1 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Q1T7F1 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Q1T7F1 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
Q1T7F1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Q1T7F1 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Q1T7F1 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Q1T7F1 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Q1T7F1 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Q1T7F1 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Q1T7F1 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Q1T7F1 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Q1T7F1 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Q1T7F1 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Q1T7F1 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Q1T7F1 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Q1T7F1 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Q1T7F1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.04□□□□□ -2.74
Q1T7F1 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Q1T7F1 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Q1T7F1 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Q1T7F1 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Q1T7F1 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Q1T7F1 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Q1T7F1 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Q1T7F1 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Q1T7F1 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
Q1T7F1 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.05□□□□□ -2.74
Q1T7F1 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Q1T7F1 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Q1T7F1 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
Q1T7F1 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Q1T7F1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
Q1T7F1 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.9 ms