Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
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DDB1Q16531 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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DDB1Q16531 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
DDB1Q16531 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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DDB1Q16531 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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DDB1Q16531 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
DDB1Q16531 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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DDB1Q16531 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDB1Q16531 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
DDB1Q16531 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDB1Q16531 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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DDB1Q16531 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
DDB1Q16531 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
DDB1Q16531 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDB1Q16531 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
DDB1Q16531 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDB1Q16531 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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DDB1Q16531 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
DDB1Q16531 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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