Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
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SHROOM2Q13796 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-3.83□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-3.84□□□□□ -3.02
SHROOM2Q13796 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
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SHROOM2Q13796 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.03
SHROOM2Q13796 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-3.93□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
SHROOM2Q13796 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
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SHROOM2Q13796 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SHROOM2Q13796 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
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SHROOM2Q13796 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SHROOM2Q13796 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
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SHROOM2Q13796 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SHROOM2Q13796 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-4.1□□□□□ -3.07
SHROOM2Q13796 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SHROOM2Q13796 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SHROOM2Q13796 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SHROOM2Q13796 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
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