Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ATRQ13535 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.165-201ENST00000363721 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ATRQ13535 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
ATRQ13535 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATRQ13535 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATRQ13535 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.75
ATRQ13535 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATRQ13535 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATRQ13535 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
ATRQ13535 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATRQ13535 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATRQ13535 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATRQ13535 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
ATRQ13535 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
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ATRQ13535 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
ATRQ13535 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ATRQ13535 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATRQ13535 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATRQ13535 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATRQ13535 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
ATRQ13535 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
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