Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SF3B2Q13435 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SF3B2Q13435 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SF3B2Q13435 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SF3B2Q13435 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SF3B2Q13435 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SF3B2Q13435 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SF3B2Q13435 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms