Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NFX1Q12986 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NFX1Q12986 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NFX1Q12986 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NFX1Q12986 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NFX1Q12986 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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