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Protein–RNA interactions for Protein: O14815
CAPN9, Calpain-9, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CAPN9
O14815
RNU6-1241P-201
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107 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR5704-201
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77 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
RNU6-24P-201
ENST00000384440
107 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
TRAJ28-201
ENST00000390509
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
RNA5SP300-201
ENST00000391197
107 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR4280-201
ENST00000582178
76 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
U2.7-201
ENST00000619197
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BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
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73 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
AL445193.1-201
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141 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
SNORA72.7-201
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94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
RNU6-687P-201
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89 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR548AX-201
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73 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR4432-201
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84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
SYCP2-202
ENST00000371001
5479 nt
APPRIS P2
TSL 1 (best)
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
SNORD115-31-201
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR4263-201
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BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR8053-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
U7.4-201
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BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR8068-201
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68 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
MIR4788-201
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BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
CAPN9
O14815
SNORD114-11-201
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CAPN9
O14815
RNA5SP66-201
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BASIC
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CAPN9
O14815
AL353803.5-201
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BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
FAS-AS1.1-201
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126 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
MIR519A2-201
ENST00000384990
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BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
RNU6-1275P-201
ENST00000391087
107 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
RNU4-63P-201
ENST00000411313
118 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
AC114755.3-201
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251 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
Y_RNA.685-201
ENST00000516532
108 nt
BASIC
-0.3
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CAPN9
O14815
snoR1.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
MIR154-201
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BASIC
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□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
RNU6ATAC29P-201
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BASIC
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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BASIC
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□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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BASIC
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□□□□□ -2.46
CAPN9
O14815
MIR4464-201
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CAPN9
O14815
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O14815
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CAPN9
O14815
SNORD38.3-201
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O14815
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CAPN9
O14815
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O14815
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O14815
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CAPN9
O14815
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O14815
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O14815
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O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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O14815
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O14815
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O14815
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O14815
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O14815
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O14815
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O14815
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CAPN9
O14815
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O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
RNU6-34P-201
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107 nt
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CAPN9
O14815
RNU6-1022P-201
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104 nt
BASIC
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CAPN9
O14815
SNORD126-201
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BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
RNU6-320P-201
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106 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
MIR3681-201
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72 nt
BASIC
-0.42
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
MIR548V-201
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80 nt
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-0.42
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
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-0.43
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
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-0.43
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
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BASIC
-0.43
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CAPN9
O14815
Y_RNA.325-201
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
Y_RNA.375-201
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-0.43
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
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109 nt
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-0.43
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CAPN9
O14815
MIR196A2-201
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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CAPN9
O14815
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BASIC
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□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
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101 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
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97 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
MIR204-201
ENST00000385200
110 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
MIR601-201
ENST00000385256
79 nt
BASIC
-0.45
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
SNORD75.1-201
ENST00000408373
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BASIC
-0.46
□□□□□ -2.48
CAPN9
O14815
Y_RNA.74-201
ENST00000362911
99 nt
BASIC
-0.47
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CAPN9
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SNORD74.6-201
ENST00000364796
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BASIC
-0.47
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CAPN9
O14815
Y_RNA.468-201
ENST00000384298
102 nt
BASIC
-0.47
□□□□□ -2.48
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