Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
LTBP3Q9NS15 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
LTBP3Q9NS15 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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LTBP3Q9NS15 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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LTBP3Q9NS15 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LTBP3Q9NS15 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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LTBP3Q9NS15 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
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LTBP3Q9NS15 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LTBP3Q9NS15 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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