Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CNGA3Q16281 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CNGA3Q16281 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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CNGA3Q16281 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CNGA3Q16281 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CNGA3Q16281 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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CNGA3Q16281 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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CNGA3Q16281 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CNGA3Q16281 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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