Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNY4P19-201ENST00000362530 96 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC1Q15751 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC1Q15751 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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