Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXD8P13378 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD8P13378 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD8P13378 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD8P13378 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD8P13378 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD8P13378 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD8P13378 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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