Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
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