Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLN8Q9UBY8 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLN8Q9UBY8 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CLN8Q9UBY8 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CLN8Q9UBY8 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.7 ms