Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMEM260Q9NX78 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TMEM260Q9NX78 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMEM260Q9NX78 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TMEM260Q9NX78 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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