Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ARHGEF3Q9NR81 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225 ms