Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
LHX9Q9NQ69 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LHX9Q9NQ69 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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LHX9Q9NQ69 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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