Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PKP2Q99959 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PKP2Q99959 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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PKP2Q99959 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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PKP2Q99959 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKP2Q99959 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKP2Q99959 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKP2Q99959 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKP2Q99959 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKP2Q99959 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKP2Q99959 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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