Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ZBED3Q96IU2 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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ZBED3Q96IU2 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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ZBED3Q96IU2 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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ZBED3Q96IU2 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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ZBED3Q96IU2 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ZBED3Q96IU2 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
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