Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
TRIM63Q969Q1 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TRIM63Q969Q1 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TRIM63Q969Q1 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms