Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPROQ16827 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPROQ16827 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.1 ms