Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TBR1Q16650 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TBR1Q16650 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TBR1Q16650 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TBR1Q16650 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TBR1Q16650 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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