Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MKRN4PQ13434 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
MKRN4PQ13434 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MKRN4PQ13434 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MKRN4PQ13434 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
MKRN4PQ13434 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
MKRN4PQ13434 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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