Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NME3Q13232 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NME3Q13232 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
NME3Q13232 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NME3Q13232 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NME3Q13232 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NME3Q13232 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NME3Q13232 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
NME3Q13232 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NME3Q13232 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
NME3Q13232 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NME3Q13232 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NME3Q13232 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NME3Q13232 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NME3Q13232 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NME3Q13232 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NME3Q13232 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NME3Q13232 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NME3Q13232 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NME3Q13232 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NME3Q13232 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NME3Q13232 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NME3Q13232 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NME3Q13232 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NME3Q13232 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NME3Q13232 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NME3Q13232 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NME3Q13232 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NME3Q13232 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NME3Q13232 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NME3Q13232 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NME3Q13232 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NME3Q13232 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NME3Q13232 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NME3Q13232 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NME3Q13232 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NME3Q13232 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NME3Q13232 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NME3Q13232 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NME3Q13232 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NME3Q13232 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NME3Q13232 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NME3Q13232 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NME3Q13232 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NME3Q13232 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NME3Q13232 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NME3Q13232 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NME3Q13232 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NME3Q13232 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NME3Q13232 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NME3Q13232 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms