Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
BPTFQ12830 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
BPTFQ12830 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.3 ms