Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-2.93□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.94□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
HMGXB3Q12766 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
HMGXB3Q12766 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.8 ms