Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SCN11AQ9UI33 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.8 ms