Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
FOXQ1Q9C009 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXQ1Q9C009 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXQ1Q9C009 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXQ1Q9C009 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXQ1Q9C009 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXQ1Q9C009 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXQ1Q9C009 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXQ1Q9C009 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXQ1Q9C009 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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FOXQ1Q9C009 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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FOXQ1Q9C009 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXQ1Q9C009 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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FOXQ1Q9C009 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXQ1Q9C009 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FOXQ1Q9C009 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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FOXQ1Q9C009 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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