Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-3.48□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-3.48□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-3.52□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
UBR3Q6ZT12 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
UBR3Q6ZT12 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
UBR3Q6ZT12 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.8 ms