Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC142Q17RM4 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC142Q17RM4 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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CCDC142Q17RM4 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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CCDC142Q17RM4 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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CCDC142Q17RM4 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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CCDC142Q17RM4 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC142Q17RM4 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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