Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ECM1Q16610 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
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ECM1Q16610 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ECM1Q16610 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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ECM1Q16610 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ECM1Q16610 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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ECM1Q16610 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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ECM1Q16610 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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ECM1Q16610 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ECM1Q16610 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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