Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
DDB1Q16531 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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DDB1Q16531 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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DDB1Q16531 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
DDB1Q16531 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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DDB1Q16531 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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DDB1Q16531 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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DDB1Q16531 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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DDB1Q16531 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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DDB1Q16531 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.3
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DDB1Q16531 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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DDB1Q16531 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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DDB1Q16531 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
DDB1Q16531 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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