Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
NEDD8Q15843 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.38□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
NEDD8Q15843 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
NEDD8Q15843 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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