Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SYCP1Q15431 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SYCP1Q15431 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SYCP1Q15431 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.31□□□□□ -2.78
SYCP1Q15431 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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