Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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COL19A1Q14993 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL19A1Q14993 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
COL19A1Q14993 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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COL19A1Q14993 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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COL19A1Q14993 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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COL19A1Q14993 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
COL19A1Q14993 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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COL19A1Q14993 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
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COL19A1Q14993 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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COL19A1Q14993 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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COL19A1Q14993 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL19A1Q14993 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
COL19A1Q14993 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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COL19A1Q14993 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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COL19A1Q14993 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
COL19A1Q14993 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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