Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SSPNQ14714 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SSPNQ14714 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SSPNQ14714 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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