Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HOXA4Q00056 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HOXA4Q00056 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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